Proje Hazırlama, İzleme ve Değerlendirme Birimi'nin görev ve yetkileri şunlardır:

• Sağlanacak destekler için genel çerçeve oluşturmak ve güncellemek,
• Başvuru koşullarını ve değerlendirme kriterlerini belirlemek,
• Başvuru rehberi hazırlamak, belli aralıklarla düzenlemek, güncellemek,
• Proje teklif çağrısını hazırlamak ve gerekli güncellemeleri yapmak,
• Proje başvurularını kabul etmek ve kayıtlarını yapmak,
• Proje tekliflerinin hazırlanmasında yararlanıcılara teknik destek sağlamak,
• Potansiyel yararlanıcılara yönelik proje hazırlama konusunda eğitim faaliyetlerini düzenlemek,
• Proje önerisine yönelik değişiklik taleplerini değerlendirme ve yönetim kuruluna sunmak,
• Hibe almaya hak kazanan projelerin sahiplerini Koordinasyon Birimine bildirmek,
• Proje izleme, değerlendirme sürecini planlamak, yürütmek ve sonuçlarını Yönetim Kurulu ve DPT'ye raporlamak,
• Desteklenecek projelerin uygulama öncesinde, uygulama sürecinde ve tamamlanmasının ardından değerlendirmelerini yapmak, performans göstergeleri ile ilgili periyodik değerlendirme raporlarını hazırlamak,
• Ajansın yürüttüğü programların, desteklediği faaliyet ve projelerin kalkınma bakımından yarattığı etki ve sonuçları ile başarı düzeylerini tespit etmek ve etki değerlendirmeleri yapmak,
• Ajansın sağlayacağı mali ve teknik desteklerin izleme ve değerlendirilmesine yönelik temel ilke ve kurallar, sorumluluklar, kullanılacak belge ve formların standartları, yararlanıcıların proje ve faaliyetlerini uygularken uymaları gereken yasal ve kurumsal altyapının tasarlanmasına katkıda bulunmak,
  • Desteklenen proje ve faaliyetler için oluşturulan izleme bilgi sisteminin koordinasyonunu sağlamak,
  • Ajanstan destek almaya hak kazanan proje sahipleri ile imzalanacak sözleşmeleri hazırlanmasında rol almak,
  • Sözleşme bilgilerinin doğruluğunu teyit etmek, yararlanıcıların uygulama kapasitesini değerlendirmek ve yararlanıcı ile birlikte proje uygulamasına ilişkin bir yol haritası hazırlamak,
  • Projenin risk ve ihtiyaç analizini yapmak ve Genel Sekreterliğe iletmek,
  • Desteklenen proje ve faaliyetlere izleme ziyaretleri gerçekleştirmek
• Projeye ilişkin olası risk faktörlerini belirlemek ve gerekli önlemlerin alınmasını temin etmek,
• Yararlanıcıların raporlarını ve ödeme planlarını değerlendirmek,
• Yapılan harcamaların usule uygunluğunu denetlemek,
  • Kabul edilen projeler ile ilgili belgeleri dosyalamak, 5 yıl süre ile muhafaza etmek.